但新版的倉頡輸入法卻充斥著嚴重的程式錯誤（也就是 bug）。在輸入一組倉頡碼並按下空白鍵後，只要該組倉頡碼對應超過一個字（也就是所謂的重複字，多個字的倉頡碼正好相同），再緊接著輸入另一個字就會出現問題。情況可能有下列幾種：

1. 出現亂碼。還好通常在一連串亂碼後，按下 return 鍵，正確的字仍會被輸入到文章裡。
2. 不會出現亂碼，但不選字就無法繼續打字，不會自動選取第一個字。
3. 不會出現亂碼，但不選字而繼續打字時，打的倉頡碼不會顯示出來。
4. 花很長的時間讀取怪異的字元。
5. 文字消失。例如打一個逗號，不選字，再打兩個其他的字，這兩個字的第一個字會消失，其前方也留下一個半形的逗號，而非應該打出的全形逗號。
6. 有時出現亂碼後，若不理會亂碼繼續打下一字而此字的倉頡碼打錯，則可能無法用 delete 鍵將之前所打的碼（包括亂碼）刪除。此時使用者可能會先按 return 鍵先將已打的文字（通常是亂碼）輸入文章，但輸入後繼續打字就可能會發生打出的字不出現在游標的位置，或甚至導致正在使用的應用程式當掉。（通常是 Carbon 程式。）
7. 有的字根本打不出。例如在許多 Carbon 程式裡打「卜竹一月金」然後選 2 也無法打出「顏」這個字。

以上情況可能在 Cocoa 程式較不明顯或不會發生，但在許多 Carbon 程式裡就經常出現。

另外，對於重複字的處理也存在著不一致的現象。在輸入有重複字的倉頡碼時，有時其重複字會全部列出來讓打字者選擇，有時卻又不列出，而必須由打字者在倉頡碼最前方加打一個「Ｘ」（重）來打出。

可以想見，由於此版倉頡輸入法支援非常多的繁簡漢字，因此有更多的字具有相同的倉頡碼，而上述的 bug 就成了極端擾人的問題。

還有，若是按 shift + ~ 再按 tab 來叫出符號表，並且按數字鍵選擇一個符號時，在 Cocoa 程式裡實際打出的是其他不相干的符號；而在 Carbon 程式裡，這些符號會被下一個字覆蓋掉。

這就是蘋果給我們的倉頡輸入法。它傷害了我這個倉頡輸入法使用者對蘋果產品的信心。